6月15日，中国科学院组织召开主题教育巡回指导组工作座谈会。中央第三十七指导组组长蒋卓庆、副组长余蔚平出席会议并讲话。中国科学院党组成员、秘书长李和风出席会议并对下一步巡回指导工作提出要求。座谈会由直属机关党委副书记、院主题教育领导小组办公室副主任杨旭主持。
6月15日，2023自然指数年度榜单（Nature Index 2023 Annual Tables）发布，中国科学院继续位列全球首位。根据此前发布的自然指数数据，中国科学院已连续十一年位列该排行榜全球第一。
6月9日，中国科学院与河北省在京举行科技合作会谈，中国科学院院长、党组书记侯建国，河北省委书记、省人大常委会主任倪岳峰出席并讲话。
6月8日，中国科学院与国务院国有资产监督管理委员会举行科技合作会谈，并签署战略合作协议。中国科学院院长、党组书记侯建国，国务院国资委党委书记、主任张玉卓出席并讲话。中国科学院副院长、党组成员汪克强主持会谈，国务院国资委党委委员、副主任赵世堂参加会谈。
6月5日，中国科学院党组召开学习贯彻习近平新时代中国特色社会主义思想主题教育读书班暨理论学习中心组集体学习会，深入学习浙江千万工程经验案例。
6月4日上午，中国空间站第四批空间科学实验样品随神舟十五号飞船返回舱返回地面，在东风着陆场交付由中国科学院牵头负责的空间应用系统。
5月30日，中国科学院党组召开学习贯彻习近平新时代中国特色社会主义思想主题教育读书班暨理论学习中心组集体学习会，学习习近平同志《论科技自立自强》。
2023年5月30日9时31分，神舟十六号载人飞船在酒泉卫星发射中心成功发射。
5月26日，中国科学院院长、党组书记侯建国在中国科学院地理科学与资源研究所开展学习贯彻习近平新时代中国特色社会主义思想主题教育专题调研。
2023年中关村论坛—“第二届碳达峰碳中和科技论坛”于5月27日在京举办。中国科学院副院长、党组副书记阴和俊，科学技术部副部长张雨东，国家能源局总工程师向海平，北京市人大常委会副主任、秘书长于军等相关部门领导出席会议并致辞。论坛由中国科学院副院长、党组成员张涛主持。
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